Сразу 6 команд Дивизии А и одна команда Национальной Дивизии вылетели в первом же этапе поменявшего формат Кубка Молдовы 2006/2007. По новой системе розыгрыша турнира на данном этапе команды проводят не два, а один матч. Причем, представители более сильного дивизиона играют с более слабым соперником на выезде.{nl}{nl}Виишоара (D3) - Искра-Сталь (D1) 2:0{nl}Флакара (D3) - Молдова-03 (D2) 2:2 (серия пенальти - 8:7){nl}Локомотив (D3)- Рапид (D2) 1:3{nl}Подиш (D3) - ЦСКА (D2) 2:2 (серия пенальти - 6:5){nl}Петрокуб (D3)- Академия (D2) 3:1{nl}Красбил (D3)- Энергетик (D2) 3:0{nl}Фортуна (D3) - Флорень (D2) 2:3{nl}Кагул(D3) - Гагаузия (D2) 4:0{nl}Колос (D3) - Интерспорт-Арома (D2) 4:4 (серия пенальти - 9:7){nl}Синтеза (D3) - Олимпия(D1) 1:12
